Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

De 1e android app voor het analyseren van gels (agarose en PAGE) bands met log scaling

* In overeenstemming met Android OS-wijzigingen, opent u alstublieft toegang tot lokale bestanden met behulp van ES File Explorer, die de drive / SD-kaarten zal rooten. U moet eerst naar ES File Explorer gaan om eerst de rooting uit te voeren. Houd er rekening mee dat Dropbox-ondersteuning is verwijderd vanwege wijzigingen in Android en Dropbox.

Dit is de eerste Android-app waarmee u gel- (zowel agarose- als PAGE-) banden kunt analyseren met een logboekgrafiek die automatisch wordt gegenereerd op basis van de markeringen. Het maakt automatische detectie en laden voor toekomstig gebruik mogelijk. Met behulp van Gabor-filter kunnen gebruikers met deze app de detectie van banden automatisch verbeteren. Voor afbeeldingen van slechte kwaliteit kunnen gebruikers klikken om handmatig een vak op de gewenste band te tekenen of op de afbeelding klikken om de opgegeven locatie te bepalen.

Afbeeldingen kunnen worden geladen vanuit galerie of dropbox, waardoor het erg handig is. De beste afbeeldingen zijn foto's die worden gegenereerd door scanners, maar zullen functioneren met goed genomen foto's van de mobiele camera's.

Foto's moeten op een direct vlak met de gel worden gemaakt.

Kenmerken van deze app omvat:

1) Specificatie van agarose of PAGINA.

2) Kleuridentificatie van markerbanden voor PAGE.

3) Geavanceerde beeldfilters - Garbor.

4) Geautomatiseerde beeldverwerking met aangepaste gebruikersinvoer indien nodig.

5) Opslaan van instellingen voor beeldverwerking voor later gemak.

6) Markeringen opslaan voor toekomstig gebruik bij gebruik van dezelfde markeringen.

7) Eenvoudige en op knoppen gebaseerde gebruikersinterface.

8) Geautomatiseerde detectie van banden.

9) Eenvoudig door de gebruiker gedefinieerd grenskader.

10) Loggrafiek van markering automatisch gegenereerd.

11) Door de gebruiker gedefinieerde locatie van specifieke banden.

12) Compatibiliteit met liggende en staande weergave van tablets en smartphones met meerdere formaten.

13) Compatibiliteit met screenshotfuncties van geanalyseerde gel- en loggrafiek smartphones en tablets voor publicaties of rapporten.

14) Aflezingen weergegeven in gelafbeelding met gemarkeerde vakjes en berekende bandgrootte.

15) Cropping-functie voor afbeeldingen voorafgaand aan analyse.

16) Bewerk functie om ongewenste bands te verwijderen.

17) Verschillende gekleurde vakken voor markeringen en banden.

18) Eenvoudige directe toegang tot Afbeeldingengalerij voor afbeeldingen.

19) Compatibel met Sybr Green, EtBr agarose gel-analyse.

20) Directe cameratoegang.

Voordelen van het gebruik van deze app voor publicaties

1) Brengt uw gel-analyse nauwkeuriger in plaats van te vertrouwen op benaderingen.

2) Waarde voegt toe aan publicaties en rapporten.

3) Nuttig lesinstrument voor bètastudenten.

4) Gestroomlijnde analyse, vermindering van menselijke fouten en subjectiviteit - u kunt nu vertrouwen op de waarden die worden gemeld door stagiairs en minder ervaren personeel!

5) Onderweg analyse met de smartphone / tablet.

6) Geautomatiseerde analyse - geen behoefte aan ruitjespapier en vervelende plotten.

7) De app is GRATIS!

8) De app is op zichzelf staand, geen internettoegang vereist (tenzij voor dropbox-analyse).

Android 6-gebruikers kunnen afbeeldingen ophalen uit de lokale "Afbeelding" -galerij. Eerdere Android-versie zullen gebruikers ondersteuning bieden voor DropBox. Dit is het gevolg van wijzigingen in Android 6 en valt buiten onze controle.

Raadpleeg de video op https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be voor instructies.

Userguide beschikbaar als pdf op http://tinyurl.com/GelApp

* Nieuwste telefoons, b. Samsung Note 8 kan problemen hebben met het opslaan van de camera. Als er dergelijke problemen zijn, gebruik dan galerij.

Om aan te halen, gebruik alstublieft:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Mobiele gelelektroforese-analysator. Natuurmethoden Applicatieopmerkingen. doi: 10.1038 / an9643

OF naar de software direct in de App Store

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Mobiele applicatiesoftware]. Ontvangen van https://play.google.com

Deze app is een product van het Antibody & Product Development Lab, Translational Research Division, Bioinformatics Institute, Agency for Science, Technology and Research, Singapore.

Makers zijn: de heer SIM Jia Zhi, de heer NGUYEN Phi Vu, en dr Samuel GAN.

                    (Poly intern) (onderzoeksmedewerker) (assistent hoofdonderzoeker)